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生物材料論文范例

前言:一篇好的文章需要精心雕琢,小編精選了8篇生物材料論文范例,供您參考,期待您的閱讀。

生物材料論文

新工科下生物醫學工程研究生教育現狀

摘要:新工科教育理念,對人才培養提出了新的更高要求,新工科背景下,現有的培養模式難以實現新工科背景下的培養目標,需要不斷改革創新。文章以湖南工業大學生物醫學工程專業為例,分析目前學術型碩士研究生培養過程中所存在的問題,從生源質量、培養方向、課程設置及教學體系、導師制培養等方面探索其培養模式,期待進一步提高碩士研究生的培養質量,為加快培養新興領域高層次人才提供參考。

關鍵詞:新工科;研究生教育;現狀及改革

1概述

為主動應對新一輪科技革命與產業變革,支撐服務創新驅動發展、“中國制造2025”等一系列國家戰略,教育部積極推進“新工科”建設,先后形成了“復旦共識”“天大行動”和“北京指南”[1-2]。生物醫學工程是一門由理、工、醫相結合的邊緣學科,涉及信息技術、電子技術、微光機電技術、網絡技術、生物技術、臨床醫學等許多個學科領域,具有交叉性強、技術密集、發展迅速的特點[3-4]。所以生物醫學工程專業研究生的培養較之其他學科有一定的挑戰性,對導師和研究生的綜合能力有更高的要求,尤其是在新工科背景下,如何培養適應我國現代社會發展要求的復合型高層次人才是我們面臨的新問題。

2生物醫學工程碩士研究生培養現狀

湖南工業大學現有15個一級學科碩士學位授權點,包含65個二級學科碩士學位授權點,22個碩士研究生專業學位類別。其中生物醫學工程是首批獲得一級學科碩士學位授予點之一,也是湖南省重點學科之一,經過多年的教學和科研實踐,生物醫學工程專業在人才培養方面取得了不錯的成績,招生規模不斷擴大,從2017年的6名到2021年41名;研究生學位論文質量水平高,多年評為省優秀論文;畢業生就業率達100%等。但隨著生物醫藥戰略性新興產業的發展,原有的生物醫學工程培養模式已難以實現人才培養目標,主要的問題如下:(1)生源質量有待進一步提高。目前一志愿報考率和上線率較低,生源主要來源于調劑,生源質量不高。(2)主要研究方向有待進一步凝練。原有的4個研究方向未結合本校和導師團隊自身優勢和特點制定,研究較廣泛,不足以適應和促進社會發展、學科發展。(3)課程體系有待進一步優化,加強資源共享和授課評估。所開設的專業課程以生物和材料相關課程為主,選修課中雖然有藥學和電子信息類相關的課程,但由于種種原因均未真正開設。所招收的學生本科專業背景也較單一,基本為化學專業和生物技術專業,難以適應經濟社會發展的多樣化需求。(4)目前本學科推行的“雙導師制”尚未得到具體落實,同時企業導師缺乏明確的職責和任務,不能真正履行導師的職責,企業導師趨于形式化。

3培養模式的探討與實踐

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生物化學實驗課程創新與改革

摘要:《生物化學實驗》既是眾多生命學科中的基礎實驗學科,同時也是前沿學科,它既與理論知識關系密切,又有自己的規律和獨特之處,在生命科學相關專業的本科生培養環節中不可或缺。但如今的生化實驗課程因種種原因存在許多弊端,在一定程度上阻礙了學科的發展和人才的培養。本文將對生化實驗課程的變革和創新展開討論,希望對該課程的改革提供一些思路。

關鍵詞:生物化學實驗;課程改革;創新

21世紀是生命科學的世紀,對于生物學科這樣一門以實驗為基礎的學科發展而言,尤其需要大量具有創新意識、創新能力的本科生作為基礎人才的儲備。生物化學作為生命科學專業重要的專業基礎課,其發展迅猛,是21世紀生命科學領域的領先學科[1]。它與分子生物學共同形成了生命科學的語言,是生命科學領域的世界語言[2]。《生物化學實驗》是生命相關學科中重要的基礎學科,同時它也是發展極為迅速的前沿學科。它既與理論知識關系密切,同時又具有自己的規律和獨特之處。實驗課程是以現有的理論為前提和基礎,通過親自動手實驗,得出所需要的結論。它不僅是理論知識的補充和延續,更是發現新知識的最佳途徑。但如今的生化實驗課程卻存在種種弊端,在一定程度上阻礙了學科的發展和人才的培養[3]。比如,受傳統教學思想的嚴重影響,實驗課程的內容包含了較多的理論知識和教師的講解,少了一些創新性和探究性;驗證性實驗課內容安排過多,缺少綜合性和設計性的實驗內容;實驗內容及實驗方法過于陳舊,與科學研究前沿嚴重脫節等等。這就使得學生的自主思維受到了較大的限制,阻礙了他們對實驗過程和結果的思考及分析,不利于培養學生的創新和科研能力。因此,為了滿足培養研究型和創新型人才的需求,就需要高校在本科階段的生化實驗教學中進行實驗課程內容和形式的改革,更好地與科學研究的前沿接軌。

1課程體系的改革

上海科技大學是一所新興學校,學校致力于培養科技創新創業人才,積極投身高等教育改革。課程體系的合理設置是一門課程成功的關鍵,因此依據學校的辦學宗旨,作為理論課程的重要輔助和支撐,我們首先在課程體系方面做出了相應的改革。當然,創新的前提是取前人之精華,去前人之糟粕,所以我們仍會延續傳統實驗教學的優勢。比如,與理論課的緊密聯系性。作為生物化學理論課程的重要輔助學科,生化實驗課程需要與理論課緊密結合,以達到鞏固學生理論知識的目的。我們在課程大綱確定初期,會按照理論課程的教授內容及課時進度,對實驗課程進行相應的內容設置。同時,為了實驗課程能夠緊跟科學研究的前沿,每年我們都會與負責教授理論課程的任課教師進行討論,優化實驗課程大綱,對于其中一些不夠完善的實驗進行修改或刪除,并相應地增加其他更為合理的實驗。傳統高校的生化實驗課程體系單一,通常會配合理論課在一到兩學期內完成,集中學習一些基本的實驗技術[4]。一方面學生理論基礎較弱,不能完全理解個別綜合性實驗的原理,只能學習一些基礎簡單的實驗;另一方面,這種課程安排會讓學生在低年級時突擊接受大量的實驗技術,到了高年級,學生真正開始運用所學實驗技術完成課題的時候,往往發現由于間隔時間較長,一些基本的實驗技能早已生疏。為了避免上述情況的發生,相較于傳統高校,我們將生化實驗課的課程體系進行了較大幅度的調整(表1)。從表中不難看出,我們的生化實驗課程設置有著完善的體系,學生從入學到畢業將接受完整的實驗課程體系的培訓。首先我們會在大一學年的第二學期安排一門實驗理論課《現代生物學基礎實驗理論》。課程主要涉及到八大類實驗技術:離心技術、電泳技術、PCR、測序技術、顯微鏡技術、細胞培養、免疫技術及模式動物。通過該課程的學習,學生能夠系統掌握現代生物學實驗室常規實驗技術理論及原理,把握生物學技術發展的趨勢和最新動態;使學生能夠將書本上的理論與身邊的科學相結合,初步培養學生科學思維的能力。經過學習,學生可以在真正的實驗課開始之前,對基本的實驗原理有所了解,這樣可以大大提升實驗課課堂的學習效率,無需再贅述實驗相關的基本知識。隨后我們將實驗課程設置為初、中、高級三個階段。初級實驗課程與傳統高校相近,在大二與理論課同步完成,主要進行生物化學基本實驗技能的培訓,表2列舉了部分初級實驗內容;中級實驗在大三完成,讓學生綜合運用學過的實驗技術完成科研上常用的較復雜的實驗項目,如免疫印跡分析(WesternBlot)、酶聯免疫吸附測定(Eli-sa)、蛋白質純化等,具體課程詳見表3。課程進行中會讓學生對實驗中的某個環節進行自主設計,初步對學生的創新性思維進行訓練;高級實驗安排在大四,會提供一些小課題供學生選擇,學生獨立進行前期文獻查找及實驗方案設計工作,最后按自主設計的實驗方案完成課題并提交論文。學生經過這樣一系列實驗課程的培養,對科研過程有了更深層的理解。不僅掌握了基本實驗技能,還逐漸形成了完整、嚴密的科研思維體系,為他們今后繼續深造打下了堅實的基礎,達到培養具有創新精神和科研能力人才的目的。

2課程內容的創新

我們在《生物化學實驗》課程的內容上積極尋求突破和創新,摒棄傳統高校仍在使用的較為陳舊的實驗教材,為學生量身打造實驗講義。增加綜合性、設計性、創新性的實驗內容,希望能夠在培養本科生基本實驗能力的基礎上加大對科研及創新能力的培養力度,充分發揮學生的主觀能動性,激發學生對該學科的自主學習興趣和研究激情。另外,我們力爭將獨立的實驗課程串聯起來,幾次小實驗可以形成一個完整的綜合性實驗,讓學生對科研中常用的復雜實驗有所了解并分步掌握。舉個例子,蛋白質是生物化學課程中最重要的一類大分子,關于蛋白質的實驗有很多,比如蛋白質的提取、純化、含量測定、定性及定量檢測等等[5]。我們會將蛋白質類的實驗集中在幾周內進行,從提取開始,每步的產物留存進行下步實驗,幾周之后,學生最終會利用SDS-PAGE和考馬斯亮藍染色法將提取純化后的蛋白質進行半定量檢測。除了蛋白質類實驗,我們在核酸、脂類、酶類等實驗中都會有這樣的課程設計。通過一系列實驗的訓練,學生學到的不再是零散的和不相關的獨立實驗,而是一套科研中常用的完整的綜合性實驗。其次,我們在教學中涉及到的實驗方法、儀器、材料等都會盡量采用目前科研中最常用的,這樣可以讓未來有意繼續深造的學生學到更多有用的知識和實驗技能,從而更快速地融入科研生活。仍然以蛋白質實驗為例,早期的蛋白質電泳所用到的聚丙烯酰胺凝膠多數需要自行配制,但隨著科研服務行業的興起,目前很多高校及研究所都已經開始使用市售的預制膠,以避免自制凝膠的不穩定性和不可重復性。因此,我們除了會安排課程讓學生學習如何制備PAGE凝膠之外,還會同時為學生提供市售預制膠進行電泳實驗,讓學生在掌握基本實驗技能的基礎上,還能與科研前沿的最新信息和知識接軌。

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生物醫學碩士學位實踐分析

本文作者:劉潔 單位:溫州醫學院研究生部

生物醫學工程(BiomedicalEngineering,BME)是理、工、醫相結合的交叉學科,崛起于20世紀60年代。現代生命科學與技術、計算機科學與技術、電子科學與技術、材料科學與技術、醫學科學與技術等廣泛滲透、交叉、融合,形成了生物醫用材料、現代工程醫學、遠程醫療工程、智能醫用儀器系統、人工器官等諸多生物醫學工程技術新領域。BME碩士教育開創了集產學研為一體的工程技術中高級人才培養模式。近年來,BME在推動現代醫學的發展中發揮著越來越重要的作用。六年前國家發改委高科技產業司就明確提出:盡快培育、壯大我國生物醫學工程產業,使其成為國民經濟新的增長點。

一、我國BME碩士專業學位研究生教育的現狀

我國BME人才培養主要依托于工科或醫科,存在培養方向多但培養人數少的問題,導致我國醫院及相關企事業單位的該領域從業人員大多沒有生物醫學工程專業背景。BME碩士學位教育的規模過小,難以滿足社會的需求,特別是融合醫、理、工等學科的復合型人才更是供不應求。據中華醫學會醫學工程學分會副主任呂忠生調查,目前全國大約有6萬家醫院,生物醫學工程專業人員只占醫院總人數的10%,與國外30%的比例相差懸殊。作為醫學工程的最大產業,國內1萬多家醫療設備企業也急需該專業的高級技術人員[1]。我國BME碩士專業學位教育在2008年以前僅在理工院校中進行,每年招生不足百人,發展處于徘徊狀態。鑒于我國急需大量BME中高級專業技術人才以及提升在職從業人員的專業水平的需要,開展BME碩士專業學位教育已刻不容緩。

二、在醫學院校開展BME碩士專業學位教育的探索和實踐

為使BME碩士專業學位教育有新的突破,國務院學位辦嘗試在醫學院校開展該項教育。我校生物醫學工程專業起步早、基礎好,特別是近年來從海內外引進了一批優質人才后,形成了一支醫、理、工相融合的師資隊伍,具備了較好開展BME碩士專業學位教育的條件和能力。2008年我校成為開展該項教育的首所醫學院校,并力求在醫療器械與醫院信息管理、基因工程與基因藥物方向做出特色。

(一)依托醫學院校的優勢資源,分層次招生宣傳,吸引優質生源。近年來醫院得到了快速地發展,醫師的學位層次提升較快,而醫技人員的學位層次相對滯后,對該學位教育具有較大的需求。作為醫學院校,要善于發揮擁有諸多的附屬醫院和教學醫院的優勢,分層次招生宣傳,以取得良好的效果。即先向醫院主管領導介紹BME碩士專業的學位特點;再請各醫院相關部門協助開展招生宣傳;同時向醫技科室寄送簡章并進行網絡招生宣傳;還可嘗試對相關企業開展定點招生宣傳。2008年我校首屆招收學生21人,招生人數列全國第二位,錄取考生的GCT成績百分位平均值81.17,列全國第四位,生源質量和數量較為理想。

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編著和專著的區別

專著概述:根據學術論文的長短,又可以分為單篇學術論文、系列學術論文和學術專著三種。一般而言,超過4—5萬字的,可以稱為學術專著。當然,照我們現在的理解,學術專著的字數可能還要更多些。 編撰學術專著比發表單篇論文更具學術價值。因此,在評定職稱時能夠獲得更多的加分和認可。詳情請參閱核心期刊中心。學術論文,學術通常是指專深而系統的學問,而論文則是指研究、討論問題的文章。因此,所謂學術論文就是在科學領域內表達科學研究成果的文章。從這一意義上理解,學術論文一般也可以稱為科學論文。在理解學術論文的時候,我們還必須把握下面兩層含義:其一,學術論文的范圍限制在科學研究領域,非此領域的文章,不能算學術論文,如新聞報道、報告文李、散文和雜文等就不能算學術論文。其二,我們說學術論文限制在學術領域,但并非說,科學領域的所有的文章都是學術論文,而只有表達科學研究新成果的文章才是學術論文。照這樣理解,科幻和科普作品就應被排除于學術論文之外了。從上述兩點來看,我們可以說,科學論文的靈魂必須是科學研究的成果。科學領域通常分為自然科學和社會科學兩大類,前者包括理、工專業,有物理、化學、生物、天文等學科;后者則包括文、史、哲、經等。我們美術教育屬于社會科學的范疇。

編著概述:一種著作方式,基本上屬于編寫,但有獨自見解的陳述,或補充有部分個人研究、發現的成果。凡無獨特見解陳述的書稿,不應判定為編著。(出自經濟日報出版社柳建明主編的《輿論學達辭典》727頁)著、編著、編都是著作權法確認的創作行為,但獨創性程度和創作結果不同。著的獨創性最高,產生的是絕對的原始作品;編的獨創性最低,產生的是演繹作品;編著則處于二者之間(編譯類似于編著,但獨創性略低于編著)。如果作者的作品不是基于任何已有作品產生的,作者的創作行為就可以視為著。一部著成的作品中可以有適量的引文,但必須指明出處和原作者。如果作者的作品中的引文已構成對已有作品的實質性使用,或者包含對已有作品的匯集或改寫成份,作者的創作行為應該視為編著。

教材概述:是由三個基本要素,即信息、符號、媒介構成,用于向學生傳授知識、技能和思想的材料。教材的定義有廣義和狹義之分。廣義的教材指課堂上和課堂外教師和學生使用的所有教學材料,比如,課本、練習冊、活動冊、故事書、補充練習、輔導資料、自學手冊、錄音帶、錄像帶、計算機光盤、復印材料、報刊雜志、廣播電視節目、幻燈片、照片、卡片、教學實物等等。教師自己編寫或設計的材料也可稱之為教學材料。另外,計算機網絡上使用的學習材料也是教學材料。總之,廣義的教材不一定是裝訂成冊或正式出版的書本。凡是有利于學習者增長知識或發展技能的材料都可稱之為教材狹義的教材就是教科書。教科書是一個課程的核心教學材料。從目前來看,教科書除了學生用書以外,幾乎無一例外地配有教師用書,很多還配有練習冊、活動冊以及配套讀物、掛圖、卡片、音像帶等。

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生物專業實驗教學與科技創新能力

[摘要]本科生科技創新能力培養成為當代教育的首要任務。生物相關專業是以實驗驗證和探索為基礎的學科,科技創新來源于實驗技術積累和思路的創新,提升學生實驗技能成為培育創新生物科技人才的基礎。本科實驗課教學是提升本科生實驗能力的基礎課程。對創新型人才的培養有重要的促進作用。圍繞加強生物學科專業本科實驗課教學提出幾點感悟和思考,重點從基于實驗培養科技創新能力、實驗課教學的啟示和意義、科技論文閱讀與寫作等方面進行闡釋。

[關鍵詞]生物專業;本科生;實驗課;科技創新

創新是引領國家發展的第一動力,創新驅動實質是人才驅動。“十三五”是我國全面建成小康社會的決勝階段,也是進入創新型國家行列的沖刺階段,大幅提升科技創新能力,本科教育是關鍵。創新能力和科學研究素養的培養是當代高等教育的一個重要方面。對于生物學科相關專業的學生,能讀寫科技論文是學習生涯的一個重要階段。生物學科是一門由許多實驗組成的驗證性和探索性的學科。除了開展一定的理論教學外,還開設大量的實驗課教學。實驗教學是對理論課教學的重要補充和完善,特別是將難以理解和記憶的知識點進行實驗驗證,最終通過實驗報告撰寫方式完成這部分內容的學習,促使學生更好地掌握理論課的關鍵知識點。

一、科技創新離不開實驗的探索

偉大的物理學家牛頓曾經說過:如果說我看得比別人更遠,那是因為我站在巨人的肩膀上。他認為自己所取得的科研成果都是在前人研究的基礎上獲得的。培養具有科技創新能力的大學生,不光需要他們掌握扎實的科學知識,也要求他們學會閱讀文獻,從學者和科學家的研究中獲得最新最前沿科學信息,學會對知識的總結、篩選、查漏補缺,最終建立自己的知識體系。通過學習提出創新思路,并通過實驗去驗證,最后建立創新的方法或理論,才能實現創新。國家提倡大眾創業、萬眾創新,要求大學生不僅要具備扎實的專業知識,更需要提高實踐探索能力,這樣才能不斷創新和創造價值。實踐是檢驗真理的唯一標準。通過實驗課對理論課的知識進行驗證,提高學生的認知和動手能力,促進學生積累經驗,才能為以后的科學創新素養奠定基礎。科技的創新和發展,離不開基礎科研和實踐,實驗課是培養和提高本科生科研素質和興趣的重要途徑。

二、實驗教學的目的和意義

(一)實驗課的意義

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化學專業支撐遠程畢業設計探索

摘要:受疫情的影響各高校畢業生無法及時返校的背景下,大學生畢業設計面臨著等諸多難題。高校化學類專業的在讀大學生可以通過線上學習理論知識和實驗視頻教學,但畢業大學生的畢業設計大多以實踐為主。因此,可以構建線上平臺,整合大學生畢業設計選題、學習、監管、答辯等多項功能,支撐大學生遠程畢業設計順利完成。

關鍵詞:疫情;線上平臺;遠程畢業設計;化學畢業生

畢業設計是大學生學業生涯所學知識的重要總結,是培養大學生實踐能力的重要環節,是大學生畢業成績評定的重要依據。在當前疫情仍沒有得到根本控制的情況下,全國各高校均延期開學,畢業生無法及時返校。離開學校的資源支撐和老師的現場指導,多數畢業生的畢業設計面臨諸多難題,尤其是以實驗為基礎的化學類專業,畢業設計工作舉步維艱,停滯不前,影響了畢業生正常的畢業流程和就業進度。因此,為確保大學生畢業設計及后續畢業就業工作正常進行,我們需要利用互聯網技術,發揮大數據優勢,整合各類網絡資源,開發各類平臺功能,構建線上平臺支撐大學生遠程畢業設計。

1大學生畢業設計存在的問題

畢業設計要求大學生在導師指導下,利用所學理論知識對現實問題進行獨立規劃、設計、實驗、分析、寫作,并形成一份完整的研究報告。因此,畢業設計是一項系統工程,要求以學生為中心,形成師生、校生、校企之間的良性交流互動。當前大學生畢業設計存在一系列問題,發現并分析這些問題,可以為構建大學生遠程畢業設計平臺提供充分依據。

1.1選題內容欠妥,可操作性不強。選擇一個合適的研究課題和方向是畢業設計的首要環節,也是影響畢業設計最終質量的重要部分。當前大學生畢業設計存在的一些普遍性問題:一、選題過大。部分學生在本科期間注重于化學的基本知識學習,能夠基本掌握無機化學、有機化學、物理化學、分析化學的專業知識,但是很少去接觸科研,畢業設計更注重于用所學的專業知識對一個具體的科學問題進行探索研究,如果沒有對這化學某一領域的未來發展把握不夠精準而盲目選題,導致選題范圍過大,失去選題現實意義,實際操作工作量過大,甚至無法保證畢業設計保質保量的完成。二、選題不明確。一些學生由于專業知識不牢,同老師溝通較少,在選題時比較隨意,沒有選擇最適合自己的選題,在實驗時只能疲于奔命,效率低下,影響最終論文的質量。在疫情影響下,尤其是以實踐為主的化學類專業大學生在完成畢業設計的過程中存在一些現實問題,這些問題會被放大,需要更加被引起重視。

1.2生搬硬套普遍,學術規范不夠。數據和資料是畢業設計的基礎,沒有足夠的實驗數據和文獻資料支撐,畢業設計的真實性和有效性就得不到保證。畢業生面臨畢業和就業的兩重壓力,常常無法合理權衡二者,做出正確的計劃安排,導致部分學生不能全身心投入畢業設計中,沒有嚴格遵守學術規范,不進行足夠的實驗分析和查閱文獻,就將相似的實驗數據和理論知識生搬硬套過來,做出的畢業設計往往存在巨大的漏洞,影響自己的答辯畢業。

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數據期刊的發展現狀及趨勢

科學研究數據應該公開分享已被科學界廣泛認可,實際上,科研人員也越來越多地引用數據庫中的數據集,例如,基于Scopus文獻列表和Databib數據庫的統計顯示,從1996年到2013年數據庫被引用次數的年均增幅為19%[1]。隨著人們對研究數據的發現和再利用的興趣增加,數據集以某種帶有質量控制和歸屬性的形式出版也日益顯得必要,數據發表和數據期刊也應運而生。本文通過對代表性數據期刊的學科屬性、出版方式、載文量演變、引證指標等進行統計和分析,全面梳理目前數據期刊的學術影響力和發展趨勢,并對國內外數據期刊出版政策進行調研,以期為我國數據期刊發展的途徑和措施提供參考。

1數據論文與數據期刊的緣起

數據是科研成果重要的支撐材料,從長遠來看,數據的價值甚至可能更高于其所產生的科研成果。科研人員越來越希望擁有訪問基于期刊文章結果數據的權限,以對數據進行個人探索并大規模挖掘,正因為如此,數據共享已經成為科研過程中利益相關者關注的焦點。早在2003年的《柏林宣言》中就已經明確將科研數據作為學術知識的一部分;2012年英國皇家學會也認為“未來真正能夠被利用的科學數據是以智能化開放數據為表現形式”,同時“敦促科研人員應該在合適的數據知識庫里存儲數據,讓人使用和驗證數據”;2017年7月,歐盟“地平線2020”計劃要求所發表的研究論文必須開放出版或在出版后存儲到開放知識庫。由此可見,科研數據的開放共享已經成為一種新興的學術要求和趨勢。在全球“數據共享與再利用”的大背景下,科研數據的存儲與管理顯得日益重要,對科研數據的傳播方式主要分為以下3種:1)數據(遵循版權協議的前提下將數據在網絡或其他媒介上);2)數據資料(以論文附件形式或將論文相關數據存儲在數據知識庫中);3)數據論文(以正式的期刊論文形式對實驗和觀察數據集進行描述)。隨著數據出版的發展,國際上有很多期刊都制訂了“科學數據共享政策”,數據期刊也應運而生。數據論文是正式的學術論文,遵從學術發表規范,接受嚴格的同行評議。數據論文與常規學術論文有很大不同:數據不是支持學術觀點的輔助性材料,而是論文主體,它并不重點報道基于科學假設和科學問題的研究結果,而是重點描述科學數據本身;發表的是可被檢索的元數據文件,用以描述單個或一組可在線訪問的數據集,其內容主要是對數據采集、獲取、處理等過程和方法的描述,不涉及對數據和研究結果的推論、發現以及假設論證,目的是讓科研群體更好地發現、獲取、理解、復用數據,并再次進行科研創新。數據期刊指那些致力于發表數據論文的期刊,其重在描述實驗和觀察數據,并有效整合傳統學術論文的內容和結構,力求在最大程度上促進數據重用,幫助用戶進行檢索和數據挖掘。數據期刊大致分為2種:一種是混合性數據期刊,出版數據論文的同時,也出版綜述、研究論文、會議報告等類型的文章;另一種是純粹數據期刊,其出版單元全部為數據論文。

2代表性數據期刊的特征分析

本文根據上述數據論文以及數據期刊的概念,對目前國內外已經開展數據出版的期刊進行調研,據不完全統計共有26種數據期刊符合上述特征。發表描述軟件以及其科學影響的軟件論文,刊發實驗過程中開發和使用的方法、材料的材料和方法論文的期刊,以及自創刊至今發表數據論文的數量小于5篇的混合性期刊均不作為本研究的重點對象。由表1可見,按照WebofScience(WoS)對期刊學科領域的分類,調研的26種數據期刊涵蓋了生命科學與生物醫學(10種)、綜合性(6種)、自然科學(地球科學、化學等5種)、應用科學(信息科學、計算機軟件2種)、藝術與人文科學(1種)、社會科學(2種)等多個研究領域。從學科分布來看,包含多個學科的綜合性期刊占比最高,有6種(23.08%),包括《F1000Re-search》《DatasetPapersinScience》《ScientificData》《DatainBrief》《中國科學數據》《Data》。地球科學、氣象與大氣科學的數據期刊數量排名第2位,有4種(15.38%),包括《EarthSystemScienceData》《GeoscienceDataJournal》《全球變化科學研究數據注冊與出版系統》《全球變化數據學報》。生物化學、基因遺傳與分子生物學學科有3種數據期刊,排第3位(11.54%),包括《HumanGenomics》《BMCResearchNotes》《GenomicsData》。其他為:植物科學、生物與醫學、信息科學與機器人科學各2種;動物學、環境與生態學、農學與生物科學、化學、考古學、心理學藝術與人文科學各1種。在26種數據期刊中,有14種是純粹的數據期刊,專門發表數據論文,另12種是以數據論文作為子欄目之一的期刊,也收錄其他類型文章。目前對于數據論文的命名還未有統一的規定,各期刊根據自己的內容特點來選取名稱,對于科研人員在檢索數據期刊或論文的過程中可能會造成一些障礙。現有的數據期刊以Datapaper命名的最多,有13種;其次是以Datanote命名,有3種;以Dataset/數據集、Datadescriptor、Dataarticle命名的分別有2種;除此之外,還有Database、Genomedatabase、DatainBrief、Metapaper這幾種命名方式。對數據論文的命名不同一定程度上反映了數據期刊發表數據論文的內容差異,例如:Pensoft出版的幾種數據期刊發表的數據論文均被稱為Datapaper,其內容是對大的數據集的描述;《BMCResearchNotes》《GigaScience》發表的Datanote文章主要描述生物學、醫學、遺傳與分子生物學方面的數據集或數據庫,并且可以從關聯的數據庫中獲取發表的數據信息;《DatasetPapersinScience》發表的Dataset是對數據集進行描述的文章;《ScientificData》發表的Datadescriptor是對有科學價值的數據集進行概述的文章;《GenomicsData》發表的DatainBrief文章對基因組數據進行詳細的描述,并包括對試驗方法和質量控制分析的介紹;《HumanGenomics》發表的數據論文以GenomeDatabase命名,表明其文章內容均為基因組數據。本次調研的26種數據期刊均采取開放獲取(OA)的方式出版,其中個別不屬于全OA出版的期刊其發表的數據論文也可被在線免費獲取。數據論文的文章處理費用(APC),除了《EarthSystemScienceData》等4刊目前是免費之外,其他數據期刊的APC為$127~3000。其中:≤$500的16種,占61.54%;$501~1000的3種,占11.54%;$1001~2000的4種,占15.38%;$2001~3000的3種,占11.54%。在出版周期方面,部分數據期刊打破了按照固定周期出版的模式,14種數據期刊只要數據論文通過同行評審,隨時可以在線發表。在26種數據期刊中,有10種被SCIE收錄,其中屬于純數據期刊的包括《GigaScience》等4種,2016年的影響因子分別為6.696、6.871、2.8和4.836,在10種數據期刊中分別排第1、2、5、8位,從影響因子指標的角度可見純數據期刊的影響力比混合數據期刊好。

3國內外數據期刊發展的現狀及出版政策

1999年美國生態學會(ESA)出版的學術期刊《Ecology》首次刊發數據論文,2001、2003、2008年OA出版商BiomedCentral先后創辦了《BMCPlantBiology》《HumanGenomics》《BMCResearchNotes》3種數據期刊,2008年Pensoft創辦了《ZooKeys》,但這5種均為混合數據期刊,只是將“數據論文”作為一個子欄目。2009年Copernicus創辦了一種純數據期刊《EarthSystemScienceData》,自此每年都有新的數據期刊創立。從2012年開始,數據期刊呈現快速發展態勢,2012—2014年間創刊的數量劇增,3年間共創辦了13種,占目前數據期刊總量的50%。我國第一種數據期刊是2014年中科院地理科學與資源研究所發行的《地理學報增刊》,該刊介紹有重要共享價值的科研數據,同時配合“全球變化科學研究數據注冊與出版系統”的運行。2016年,中科院計算機網絡信息中心創辦了《中國科學數據》數據期刊,中科院地理科學與資源研究所于2017年創辦了《全球變化數據學報》。從數據論文的發表數量來看,自2012年開始,數據數量平均每年以115.42%的比例增加,至2016年發表數量達到最高,為1616篇。從發表數據論文的總量(表1)來看,截至2017年《DatainBrief》發文量最大,為1553篇。為了實現數據的可利用,必須制定合適的數據共享政策及機制,以促使科研人員能夠有效地共享并利用數據。目前國際上一些有影響力的大型出版社紛紛對科研數據的存儲以及傳播提出明確政策,幾個典型數據期刊出版社的數據出版政策詳見表2。

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藥物化學論文投稿問題思考

一、資料與方法

選取ChineseChemicalLetters期刊2015—2017年藥物化學專業稿件中退稿(或大修)稿件328篇。根據審稿專家意見、副主編意見和編輯專業知識,按照退稿原因進行分類和分析,歸納總結并提出具體建議和措施。

二、問題與分析

(一)摘要(Abstract)的信息量不全

摘要的內容是全文的核心內容,在文獻檢索中起著十分重要的作用。摘要應該具有獨立性和自明性,并且具有與論文同等量的主要信息,即不閱讀全文,就能獲得必要的信息[2,3]。但是有些論文的摘要不能體現全文的主要內容,信息量偏少,要素不全,論述方法或結果太籠統。一般情況下,摘要由目的(Objective)、方法(Methods)、結果(Results)與結論(Conclusions)四部分組成,各部分應該具體明確,并且應該給出主要的實驗結果和結論。

(二)引言(Introduction)部分的設計思路不明確、重點不突出

引言部分要求重點突出,避免空泛,通過研究相關文獻后直接引出需要解決的問題[3]。如何指出當前研究的不足并有目的地引導出自己研究的重要性是引言寫作的一個難點和重點。引言的撰寫要有一定的邏輯性,并且不能出現較多語法錯誤。引言一般應該與結論相呼應,在引言中提出的問題,在結論中應有解答或討論說明。如果作者未能在論文的引言部分就其分子設計思想提出有說服力的依據(例如藥效團的拼合并非隨意組合等),并且對母體藥物的結構活性關系(SAR)沒有給出必要的說明,給讀者的印象是拼合片段的選擇存在隨意性,這樣就會降低審稿專家對論文創新性的評價。其次,在生物活性篩選中雖然發現了一些與陽性對照藥物作用強度相近的新化合物,但是作者對這些新化合物的優勢或潛在優勢沒有提出有說服力的觀點。文章的結論僅限于對實驗結果的一般性概括,不能體現論文實驗結果的重要性;另外,如果論文的英文寫作語法錯誤還較多,這樣的稿件一定會被退稿。例如有一篇抗菌藥物合成的論文,審稿人提出:(1)在設計思路上,作者采用片段拼合方法設計新化合物,依據不充分。建議作者在分析具有明確抗菌活性化合物藥效團基礎上,采用結構多樣的片段與藥效團接合,獲得新化合物。(2)英文撰寫需要修改,過多重復,并且存在很多語法錯誤。再例如對于4-苯氨基喹唑啉類激酶抑制劑的報道已經很多,如果還是利用該骨架進行衍生合成新化合物,關鍵是要能做出自己的特色。如果對于化合物的設計思想并沒有給出充分的理由,對于取代基的性質和種類也沒有進行詳細的研究,這樣的論文會讓審稿專家和讀者感覺化合物設計比較盲目,沒有創新的設計思路。如果根據母藥或已有藥物(leadcompound)設計新化合物,設計思想要有事實依據,指出候選藥物的不足要有文獻或數據支持,不能猜想,不然審稿人就會認為設計思想的基礎不可靠。如果發現化合物體外(體內)活性與化合物結構不符一定要分析具體原因,否則審稿人也會提出疑問。最終設計的化合物要向著活性更好的化合物結構靠近。

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